El perclorato en el agua se debe principalmente a fuentes antropogénicas como fertilizantes, fuegos artificiales, combustible para cohetes, etc. El análisis de trazas de perclorato en muestras de agua es una tarea crítica. El alto contenido de aniones estándar conduce a picos grandes que interfieren con el pico de perclorato muy pequeño. En la técnica multidimensional convencional (heart cut), la fracción de perclorato –ampliamente liberada de los aniones interferentes– se vuelve a inyectar en la columna, lo que proporciona un pico agudo.